بهینه سازی روش HRM-Real Time PCR برای تشخیص کرم قلب
نویسنده
چکیده مقاله:
مطالعه اکولوژی انگلهای سگ های ولگرد از اهمیت زیادی برخورداراست. باتوجه به امکان انتقال انگل های مشترک از سگ های ولگرد به انسان، این انگل ها از جمله خطرات بالقوه جوامع انسانی امروز محسوب می شود که نیاز به مطالعات جامع دارد. دیروفیلاریا ایمیتیس انتشار جهانی دارد و ایران یکی از مناطق اندمیک برای این آلودگی است.ازاین رو، تحقیق حاضر با هدف بررسی آلودگی به دیروفیلاریا ایمیتیس در سگ ها ی ولگرد استان های گیلان، قزوین وما زندران با استفاده از روش HRM Real -Time PCR و مقایسه آن با روش PCR معمولی انجام شد. مهمترین سوال تحقیق این بود که: آیا روش HRM Real -Time PCRقادر به تفریق گونه های فیلرهای آلوده کننده سگ در ایران و همچنین قادر به تشخیص عفونت مخفی است؟به این منظوردر بررسی حاضر، نمونه خون های حاوی ضد انعقاد از 138 قلاده سگهای ولگرد در استانهای گیلان، مازندران و قزوین با روش مولکولی مورد ارزیابی قرار گرفتند.دراین مطالعه قسمتی از ژنcoxI دیروفیلاریا ایمیتیس (به طولbp 256 ) تکثیر گردید. روش HRM Real -Time PCRبا استفاده از دستگاه روتورژن انجام شد. نتایج مطالعه حاضر نشان داد که در مجموع از 138 نمونه جمع آوری شده ازسه استان گیلان، مازندران و قزوین با روش PCR معمولی وHRM Real -Time PCR 8/47 % از نمونه ها مثبت شدند. در مطالعه حاضر حساسیت روش PCR وHRM Real -Time PCR100 % حاصل شد (حساسیت و ویژگی براساس روش استاندارد طلایی PCR و تعیین توالی قطعه های تکثیر شده، محاسبه شد)ویژگی هردوروش 100% است. نتایج HRM Real -timePCR نشان داد که PCR براساس ژن coxI انگل قادر به تشخیص آلودگی است. نمونه هایی کهPCR مثبت بودند، دارای میانگین دمای ذوب ºc 66/ 76بودند ، این توالی ها در سطح نوکلئوتید اختلاف 2-1 % داشتند، اما ترجمه این توالی ها به اسید آمینه تشابه 100% نشان داد، به عبارت دیگر دمای ذوب قادر به تفریق 2-1%اختلاف درسطح نوکلئوتید بود. اما در نمونه های مورد بررسی در مطالعه حاضر اختلافی در سطح گونه دیروفیلاریا ایمیتیس یا احتمال سویه زایی مشاهده نشد. نتایج مطالعه حاضر نشان داد که به منظور تشخیص آلودگی سگها به دیروفیلاریازیس لازم است روشهای ملکولی بکارگرفته شوند و روش HRM Real-TimePCR که مبتنی برتغییرات دمای ذوب ناشی از اختلاف در سطح نوکلئوتید ها است، می تواند به منظور تفریق گونه فیلر آلوده کننده استفاده شود.
منابع مشابه
بررسی حساسیت روش Real-time PCR برای تشخیص ویروس بیماری نیوکاسل
بیماری نیوکاسل یکی از مخربترین بیماریهای ویروسی طیور در سرتاسر جهان است. باتوجه به اینکه روشهای سنتی قابلیت محدودی در کنترل این بیماری دارند، هدف از انجام این مطالعه استفاده از تکنولوژیهای نوین برای تشخیص به موقع بیماری جهت کاهش خسارت پیش روی صنعت طیور میباشد. در این مطالعه به منظور تشخیص ویروس نیوکاسل، یک روش Real-time-PCR بهینه سازی گردید. استخراج RNA با استفاده از کیت RNease mini (شرکت ...
متن کاملمقایسه حساسیت دو روش real-time pcr و rt-pcr برای تشخیص ویروس بیماری زای طیور
بیماری نیوکاسل یکی از مخرب ترین بیماری های ویروسی طیور در سرتاسر جهان است. با توجه به اینکه روش های سنتی قابلیت محدودی در کنترل این بیماری دارند، هدف از انجام این مطالعه استفاده از تکنولوژی های نوین برای تشخیص به موقع بیماری جهت کاهش خسارت پیش روی صنعت طیور می باشد. استخراج rna از واکسن نیوکاسل سویه b1 و با استفاده از کیت rnease mini (شرکت کیاژن، آمریکا) و بر اساس دستورالعمل شرکت سازنده انجام ش...
15 صفحه اولارزیابی کمی و بهینه سازی تشخیص DNA آسپرژیلوس فومیگاتوس در نمونه خون با استفاده از تکنیک Real time PCR
Background and purpose: Ïnvasive aspergillosis (ÏÂ) is a serious opportunistic infection caused by various species of Âspergillus in immnucompromissed individuals. Basically, rapid and early diagnosis prevents ÏÂ progression. The purpose of this study was to quantify and optimize detection of Âspergillus fumigatus DNÂ in blood samples using Real Time PÇR. Materials and methods: Five millil...
متن کاملبررسی کمی مارکر cea برای تشخیص میکرومتاستاز در سرطان معده با روش real-time pcr
چکیده ندارد.
15 صفحه اولراه اندازی روش اختصاصی و حساس Real-Time PCR به منظور تشخیص گونه های بروسلا
مقدمه و هدف: بروسلوز یک بیماری مشترک بین انسان و دام ویک مشکل بهداشت عمومی در سراسر جهان می باشد.بروسلوز باعث سقط جنین ،اختلالات باروری ،عفونت های تناسلی،کاهش شیر،اورتریت و اپیدیدیمیت در میزبان اصلی می شود و از این جهت باعث عوارض مزمن و تحمیل هزینه های درمانی فراوان به بیماران و ضررهای اقتصادی زیاد به دامداران می گردد.این بیماری،در تمام نقاط ایران پراکنده است و ایران یکی ازمناطق آندمیک آل...
متن کاملتشخیص میکرومتاستاز کارسینومای سلول کلیوی توسط مارکر CA9 با استفاده از روش Real-Time RT PCR
چکید ه سابقه و هدف حدود 40 درصد از مبتلایان به سرطان کلیه حتی پس از خارج نمودن کامل کلیه(رادیکال نفرکتومی) دچار متاستاز میشوند. بنابراین یافتن راهی برای تشخیص شروع متاستاز بسیار ارزشمند میباشد. در تحقیق حاضر، امکان تشخیص میکرومتاستاز سرطان کلیه با استفاده از نشانگر( (CA9 مورد بررسی قرار گرفته است. مواد و روشها در یک مطالعه تجربی، از 30 بیمار مبتلا به سرطان کلیه که به بیمارستان دکتر...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 10 شماره ویژه نامه شماره 2 دوازدهمین کنگره دامپزشکی ایران
صفحات 21- 32
تاریخ انتشار 2018-09-02
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023